Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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