Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YJL120WYJL120W 324 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YBR277CYBR277C 402 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 SWR1YDR334W 4545 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YGR067CYGR067C 2415 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 SUL1YBR294W 2580 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 VMR1YHL035C 4779 nt2.8□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 IRR1YIL026C 3453 nt2.8□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 SMY1YKL079W 1971 nt2.8□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 RPS22AYJL190C 393 nt2.8□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YME2YMR302C 2553 nt2.8□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 PTP3YER075C 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR544CYDR544C 429 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 ACB1YGR037C 264 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 ATG11YPR049C 3537 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 CYR1YJL005W 6081 nt2.79□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YER138CYER138C 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YER160CYER160C 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YJR027WYJR027W 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YML039WYML039W 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YML045WYML045W 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YMR050CYMR050C 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 RIC1YLR039C 3171 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 SNC1YAL030W 354 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.78□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 ILS1YBL076C 3219 nt2.78□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SCH9YHR205W 2475 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SWI6YLR182W 2412 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SDC25YLL016W 3147 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YBL012CYBL012C 402 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 KTI11YBL071W-A 249 nt2.77□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 RTT10YPL183C 3042 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 LYS14YDR034C 2373 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YPL216WYPL216W 3309 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 MNE1YOR350C 1992 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 BRP1YGL007W 378 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YGR050CYGR050C 357 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PAU8YAL068C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PAU18YLL064C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PAU6YNR076W 363 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PAU20YOL161C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 RPL33AYPL143W 324 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 VPS16YPL045W 2397 nt2.76□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 FIR1YER032W 2631 nt2.75□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SRP14YDL092W 441 nt2.75□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 DUG2YBR281C 2637 nt2.75□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SWI5YDR146C 2130 nt2.75□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 AFI1YOR129C 2682 nt2.75□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 HAL9YOL089C 3093 nt2.74□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PAU3YCR104W 375 nt2.74□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YDL196WYDL196W 330 nt2.74□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 RPS25BYLR333C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 TCB2YNL087W 3537 nt2.74□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 MSB2YGR014W 3921 nt2.73□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 TFB5YDR079C-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.73□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 APL5YPL195W 2799 nt2.73□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 SNF5YBR289W 2718 nt2.72□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PUT3YKL015W 2940 nt2.72□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 GCV2YMR189W 3105 nt2.72□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 PIG1YLR273C 1947 nt2.72□□□□□ -1.97
YLL054CQ12244 KRE33YNL132W 3171 nt2.71□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YCL046WYCL046W 324 nt2.71□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 MSC6YOR354C 2079 nt2.71□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 CRM1YGR218W 3255 nt2.71□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 MGM1YOR211C 2646 nt2.7□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YIL174WYIL174W 228 nt2.7□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.7□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 KAP123YER110C 3342 nt2.7□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 SET2YJL168C 2202 nt2.7□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 ELG1YOR144C 2376 nt2.69□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 SLY1YDR189W 2001 nt2.69□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 MNL2YLR057W 2550 nt2.69□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YMR326CYMR326C 309 nt2.69□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 MLH1YMR167W 2310 nt2.69□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 INP51YIL002C 2841 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 SRO77YBL106C 3033 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YCR043CYCR043C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 ATP7YKL016C 525 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 CRS5YOR031W 210 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 CBF2YGR140W 2871 nt2.68□□□□□ -1.98
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