Protein–RNA interactions for Protein: Q12104

SWT1, Transcriptional protein SWT1, yeastyeast

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWT1Q12104 snR51snR51 107 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 MUK1YPL070W 1839 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 MSC6YOR354C 2079 nt1.93□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 SSD1YDR293C 3753 nt1.92□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.92□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YDR048CYDR048C 315 nt1.92□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YOL098CYOL098C 3114 nt1.92□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 NOP14YDL148C 2433 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 HCS1YKL017C 2052 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 NPC2YDL046W 522 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YEL057CYEL057C 702 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 PCC1YKR095W-A 267 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YGR250CYGR250C 2346 nt1.91□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 NUP170YBL079W 4509 nt1.9□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 SLY1YDR189W 2001 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 CFT2YLR115W 2580 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 HTL1YCR020W-B 237 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YDL118WYDL118W 381 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YDR426CYDR426C 378 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 TMA7YLR262C-A 195 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 MCD1YDL003W 1701 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 HIR3YJR140C 4947 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 TOR2YKL203C 7425 nt1.9□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 TFC3YAL001C 3483 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 MAK10YEL053C 2202 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 MSH5YDL154W 2706 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 TRX1YLR043C 312 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YLR255CYLR255C 354 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 ELG1YOR144C 2376 nt1.89□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 INP2YMR163C 2118 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 CTR9YOL145C 3234 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YAR029WYAR029W 225 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 ZIP1YDR285W 2628 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 DCP2YNL118C 2913 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 UBR2YLR024C 5619 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YLL032CYLL032C 2478 nt1.88□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YGL149WYGL149W 306 nt1.87□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 RPB10YOR210W 213 nt1.87□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 RLM1YPL089C 2031 nt1.87□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 SEC16YPL085W 6588 nt1.87□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 VTC1YER072W 390 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 IRE1YHR079C 3348 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YMR045CYMR045C 5268 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 PUT3YKL015W 2940 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 HSH155YMR288W 2916 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 MYO4YAL029C 4416 nt1.86□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 snR72snR72 98 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YIL102CYIL102C 306 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YJL135WYJL135W 318 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 DBP6YNR038W 1890 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 SEY1YOR165W 2331 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 SEC63YOR254C 1992 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 SPP41YDR464W 4308 nt1.85□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 SRP14YDL092W 441 nt1.84□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.84□□□□□ -2.11
SWT1Q12104 AGC1YPR021C 2709 nt1.83□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 TDA9YML081W 3756 nt1.83□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 HMI1YOL095C 2121 nt1.83□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 APL5YPL195W 2799 nt1.82□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 MLH3YPL164C 2148 nt1.82□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 ENV11YGR071C 2583 nt1.82□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YPR063CYPR063C 423 nt1.82□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 SAP190YKR028W 3102 nt1.81□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 GCN2YDR283C 4980 nt1.8□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 HSL1YKL101W 4557 nt1.8□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 FRK1YPL141C 2598 nt1.8□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 UTP22YGR090W 3714 nt1.8□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 BRE1YDL074C 2103 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YNL144CYNL144C 2223 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 SAS3YBL052C 2496 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 MSH6YDR097C 3729 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YIL032CYIL032C 357 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 DGR1YNL130C-A 147 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 MDM20YOL076W 2391 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YJR039WYJR039W 3366 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 ATG11YPR049C 3537 nt1.79□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 NIP100YPL174C 2607 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 APL2YKL135C 2181 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YCR022CYCR022C 345 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YDR344CYDR344C 444 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 YOL160WYOL160W 342 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 DGR2YKL121W 2559 nt1.78□□□□□ -2.12
SWT1Q12104 PIG1YLR273C 1947 nt1.78□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.77□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 NEO1YIL048W 3456 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 ZIP2YGL249W 2115 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 OST1YJL002C 1431 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 SLN1YIL147C 3663 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 PAU3YCR104W 375 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 ALG13YGL047W 609 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 TBS1YBR150C 3285 nt1.76□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 SPC98YNL126W 2541 nt1.75□□□□□ -2.13
SWT1Q12104 YHL042WYHL042W 453 nt1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.2 ms