Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 HDA3YPR179C 1968 nt2.2□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YFL032WYFL032W 321 nt2.2□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.2□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MAM33YIL070C 801 nt2.2□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YGR265WYGR265W 411 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 PAU18YLL064C 363 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 PAU6YNR076W 363 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 NUT2YPR168W 474 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 IRE1YHR079C 3348 nt2.19□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MSH6YDR097C 3729 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 FKS1YLR342W 5631 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 RPL35AYDL191W 363 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MCM22YJR135C 720 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YCL046WYCL046W 324 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 NEO1YIL048W 3456 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 SPP41YDR464W 4308 nt2.18□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 PUT3YKL015W 2940 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 CYC7YEL039C 342 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 UPS1YLR193C 528 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 TMA7YLR262C-A 195 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MSC6YOR354C 2079 nt2.17□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 RIM20YOR275C 1986 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 AGC1YPR021C 2709 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MAK10YEL053C 2202 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 TOR2YKL203C 7425 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YOP1YPR028W 543 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 ZRG17YNR039C 1818 nt2.16□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 DCP2YNL118C 2913 nt2.15□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 MYO4YAL029C 4416 nt2.15□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 RPL39YJL189W 156 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 TAR1YLR154W-C 375 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YLR255CYLR255C 354 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 RPL38YLR325C 237 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 HTB2YBL002W 396 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 SLY1YDR189W 2001 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 RLM1YPL089C 2031 nt2.15□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 USO1YDL058W 5373 nt2.14□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.14□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 RFX1YLR176C 2436 nt2.13□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 LYS14YDR034C 2373 nt2.13□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 GYP5YPL249C 2685 nt2.13□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.13□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 HMI1YOL095C 2121 nt2.13□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 MUK1YPL070W 1839 nt2.12□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YJR039WYJR039W 3366 nt2.12□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.12□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.12□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 STE5YDR103W 2754 nt2.12□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 MSH5YDL154W 2706 nt2.11□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 PCC1YKR095W-A 267 nt2.11□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 snR51snR51 107 nt2.11□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 ZIP1YDR285W 2628 nt2.11□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.1□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 FRK1YPL141C 2598 nt2.1□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 HIR3YJR140C 4947 nt2.09□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 HSH155YMR288W 2916 nt2.09□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YDR048CYDR048C 315 nt2.09□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 YER181CYER181C 324 nt2.09□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 RPB10YOR210W 213 nt2.09□□□□□ -2.07
SLX4Q12098 NPC2YDL046W 522 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YDR426CYDR426C 378 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YFL063WYFL063W 456 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 ATG11YPR049C 3537 nt2.08□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 snR65snR65 100 nt2.07□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 PAU3YCR104W 375 nt2.07□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.07□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 INP2YMR163C 2118 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 MDM20YOL076W 2391 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YGL149WYGL149W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 TRX1YLR043C 312 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YBL012CYBL012C 402 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 TBS1YBR150C 3285 nt2.06□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.05□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 GCN2YDR283C 4980 nt2.05□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YLL032CYLL032C 2478 nt2.05□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.05□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 MVP1YMR004W 1536 nt2.05□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 HSL1YKL101W 4557 nt2.04□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 LRE1YCL051W 1752 nt2.04□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 LHS1YKL073W 2646 nt2.04□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 MLH3YPL164C 2148 nt2.03□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 HTL1YCR020W-B 237 nt2.03□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 SRP14YDL092W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 YAR029WYAR029W 225 nt2.03□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 ADR1YDR216W 3972 nt2.03□□□□□ -2.08
SLX4Q12098 UTP21YLR409C 2820 nt2.03□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 SAS3YBL052C 2496 nt2.02□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YOR093CYOR093C 4947 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YMR045CYMR045C 5268 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 snR72snR72 98 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 YJL135WYJL135W 318 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 SFB2YNL049C 2631 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 DBP6YNR038W 1890 nt2.01□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 PKH3YDR466W 2697 nt2□□□□□ -2.09
SLX4Q12098 DGR2YKL121W 2559 nt2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms