Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 NUP192YJL039C 5052 nt1.72□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 HMRA1YCR097W 381 nt1.72□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 RPL31AYDL075W 342 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YAP6YDR259C 1152 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 RTR1YER139C 681 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 ANS1YHR126C 480 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 HIT1YJR055W 495 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 TRX1YLR043C 312 nt1.71□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 HMI1YOL095C 2121 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 LYS14YDR034C 2373 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 VPS15YBR097W 4365 nt1.7□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 FRK1YPL141C 2598 nt1.69□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YPL229WYPL229W 621 nt1.69□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YOP1YPR028W 543 nt1.69□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 SWI6YLR182W 2412 nt1.69□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 RPL26AYLR344W 384 nt1.68□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 ISF1YMR081C 1017 nt1.68□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 HCH1YNL281W 462 nt1.68□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 SAR1YPL218W 573 nt1.68□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 DCP2YNL118C 2913 nt1.68□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YHR210CYHR210C 1026 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YIL059CYIL059C 366 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YLR334CYLR334C 381 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 PCF11YDR228C 1881 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 ZIP1YDR285W 2628 nt1.67□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YKL083WYKL083W 615 nt1.66□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 YPR012WYPR012W 255 nt1.66□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 IRA1YBR140C 9279 nt1.66□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 MON2YNL297C 4911 nt1.65□□□□□ -2.14
RIM20Q12033 RFX1YLR176C 2436 nt1.65□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 EFR3YMR212C 2349 nt1.65□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 MLH3YPL164C 2148 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 SBE22YHR103W 2559 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 snR56snR56 88 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 ATG31YDR022C 591 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YOR121CYOR121C 306 nt1.64□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 ATP6Q0085 780 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 EMC5YIL027C 426 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YPL261CYPL261C 309 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 SPO24YPR036W-A 204 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YCS4YLR272C 3531 nt1.63□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 CTF4YPR135W 2784 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 CYC7YEL039C 342 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 ENV11YGR071C 2583 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 DGR2YKL121W 2559 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YOR019WYOR019W 2193 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YLR419WYLR419W 4308 nt1.62□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 CHS1YNL192W 3396 nt1.61□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 KAP122YGL016W 3246 nt1.61□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 RKM1YPL208W 1752 nt1.61□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 CCH1YGR217W 6120 nt1.61□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 SLY1YDR189W 2001 nt1.61□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YLL032CYLL032C 2478 nt1.6□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 NUT2YPR168W 474 nt1.6□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 PIG1YLR273C 1947 nt1.6□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 SRP14YDL092W 441 nt1.59□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.59□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YJL022WYJL022W 309 nt1.59□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 YBR174CYBR174C 315 nt1.59□□□□□ -2.15
RIM20Q12033 ALK1YGL021W 2283 nt1.59□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 MUK1YPL070W 1839 nt1.59□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 GIM4YEL003W 336 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 PAU2YEL049W 363 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 MRPL31YKL138C 396 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 RPL40BYKR094C 387 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 SSK2YNR031C 4740 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 MSH3YCR092C 3057 nt1.58□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 BST1YFL025C 3090 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 NCA2YPR155C 1851 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YJR003CYJR003C 1560 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 VPS55YJR044C 423 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 COF1YLL050C 432 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.57□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 NUT1YGL151W 3399 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 UPS1YLR193C 528 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 LAA1YJL207C 6045 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 APL2YKL135C 2181 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 UFD2YDL190C 2886 nt1.56□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 CDC25YLR310C 4770 nt1.55□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YHL041WYHL041W 450 nt1.55□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YBR012CYBR012C 420 nt1.55□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 PET127YOR017W 2403 nt1.54□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 SAS3YBL052C 2496 nt1.54□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.54□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 IRC23YOR044W 474 nt1.54□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YNL058CYNL058C 951 nt1.53□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YOR029WYOR029W 336 nt1.53□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.53□□□□□ -2.16
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