Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 MSH6YDR097C 3729 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 OSH6YKR003W 1347 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 LYS14YDR034C 2373 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 FAB1YFR019W 6837 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YHR210CYHR210C 1026 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 HSH155YMR288W 2916 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 PAU3YCR104W 375 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 RFX1YLR176C 2436 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 MUK1YPL070W 1839 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.9□□□□□ -2.1
TRM8Q12009 YOP1YPR028W 543 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 LRE1YCL051W 1752 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YBL012CYBL012C 402 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 MDM20YOL076W 2391 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YJR039WYJR039W 3366 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 PAC1YOR269W 1485 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YHL041WYHL041W 450 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 NUT2YPR168W 474 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 RIM20YOR275C 1986 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 MLH3YPL164C 2148 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 MSH5YDL154W 2706 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 CYC7YEL039C 342 nt1.87□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.87□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 RPL38YLR325C 237 nt1.87□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 SAS3YBL052C 2496 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 SGO1YOR073W 1773 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 LHS1YKL073W 2646 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 UTP21YLR409C 2820 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 RKM1YPL208W 1752 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 YNL144CYNL144C 2223 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 TRX1YLR043C 312 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 DGR2YKL121W 2559 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 UPS1YLR193C 528 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM8Q12009 HIR3YJR140C 4947 nt1.84□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 SAR1YPL218W 573 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 SFB2YNL049C 2631 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YLL032CYLL032C 2478 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 PCC1YKR095W-A 267 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 RPB10YOR210W 213 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 SAC3YDR159W 3906 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 IRC20YLR247C 4671 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YBP1YBR216C 2025 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YHL037CYHL037C 402 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YKL136WYKL136W 399 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 MRPL31YKL138C 396 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 snR51snR51 107 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 PEP1YBL017C 4740 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 RPL40BYKR094C 387 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 INP2YMR163C 2118 nt1.79□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YAF9YNL107W 681 nt1.79□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 TIM18YOR297C 579 nt1.79□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YOR093CYOR093C 4947 nt1.79□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 PKH3YDR466W 2697 nt1.78□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 CTF4YPR135W 2784 nt1.78□□□□□ -2.12
TRM8Q12009 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 SKI3YPR189W 4299 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 PIG1YLR273C 1947 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 MYO2YOR326W 4725 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 SBE22YHR103W 2559 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YDR102CYDR102C 333 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 CSN9YDR179C 489 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 HTB2YBL002W 396 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 SRP14YDL092W 441 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 EMC5YIL027C 426 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YKL118WYKL118W 312 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 SEC5YDR166C 2916 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 APL2YKL135C 2181 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 RPL35AYDL191W 363 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YDR426CYDR426C 378 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 PAU2YEL049W 363 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 ZIP2YGL249W 2115 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 TAR1YLR154W-C 375 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 RTP1YMR185W 2946 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 NPC2YDL046W 522 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YJR011CYJR011C 786 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 SDH2YLL041C 801 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 NOC3YLR002C 1992 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 VPS15YBR097W 4365 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 ANS1YHR126C 480 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YOR199WYOR199W 330 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 KIP1YBL063W 3336 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 YOR019WYOR019W 2193 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM8Q12009 RPL31AYDL075W 342 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM8Q12009 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.71□□□□□ -2.14
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