Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms