Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLEQ07864 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLEQ07864 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLEQ07864 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLEQ07864 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLEQ07864 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms