Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms