Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms