Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms