Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms