Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms