Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms