Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms