Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms