Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms