Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms