Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms