Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms