Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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FAM3AP98173 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3AP98173 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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