Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRB1P82279 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRB1P82279 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRB1P82279 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRB1P82279 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRB1P82279 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRB1P82279 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRB1P82279 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms