Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX5P78411 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX5P78411 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX5P78411 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX5P78411 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX5P78411 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX5P78411 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX5P78411 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX5P78411 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX5P78411 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX5P78411 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX5P78411 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms