Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms