Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms