Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms