Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms