Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms