Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms