Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms