Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX16P57768 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX16P57768 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX16P57768 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX16P57768 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX16P57768 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX16P57768 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX16P57768 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX16P57768 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX16P57768 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX16P57768 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX16P57768 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms