Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB25P57735 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB25P57735 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB25P57735 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB25P57735 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB25P57735 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB25P57735 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB25P57735 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms