Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP7P55210 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP7P55210 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP7P55210 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP7P55210 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASP7P55210 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASP7P55210 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms