Protein–RNA interactions for Protein: P54868

HMGCS2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS2P54868 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS2P54868 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS2P54868 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms