Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMTNP53814 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMTNP53814 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms