Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 MVP1YMR004W 1536 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 STE11YLR362W 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SPF1YEL031W 3648 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 ZRG17YNR039C 1818 nt2.45□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.45□□□□□ -2.02
RTA1P53047 BLI1YKL061W 342 nt2.45□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SDH2YLL041C 801 nt2.45□□□□□ -2.02
RTA1P53047 TRA1YHR099W 11235 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 MAK10YEL053C 2202 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 PAU18YLL064C 363 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 JLP2YMR132C 627 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YNL028WYNL028W 318 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 PAU6YNR076W 363 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 MSB1YOR188W 3414 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SYH1YPL105C 2550 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 PHO2YDL106C 1680 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YPR097WYPR097W 3222 nt2.44□□□□□ -2.02
RTA1P53047 ZIP1YDR285W 2628 nt2.43□□□□□ -2.02
RTA1P53047 MRP10YDL045W-A 288 nt2.43□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.43□□□□□ -2.02
RTA1P53047 GIP3YPL137C 3831 nt2.43□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SGS1YMR190C 4344 nt2.43□□□□□ -2.02
RTA1P53047 MLH1YMR167W 2310 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 RAV1YJR033C 4074 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 CDC36YDL165W 576 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YDR209CYDR209C 414 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 IST2YBR086C 2841 nt2.42□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SIR3YLR442C 2937 nt2.41□□□□□ -2.02
RTA1P53047 YEF3YLR249W 3135 nt2.4□□□□□ -2.02
RTA1P53047 MCD1YDL003W 1701 nt2.4□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SEC16YPL085W 6588 nt2.4□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YLL032CYLL032C 2478 nt2.4□□□□□ -2.03
RTA1P53047 RPL37BYDR500C 267 nt2.4□□□□□ -2.03
RTA1P53047 KTI11YBL071W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YNL337WYNL337W 255 nt2.4□□□□□ -2.03
RTA1P53047 snR55snR55 98 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 ABF2YMR072W 552 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 CSE2YNR010W 450 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YCL046WYCL046W 324 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 SPT21YMR179W 2277 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 UBP1YDL122W 2430 nt2.39□□□□□ -2.03
RTA1P53047 CTR9YOL145C 3234 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 SAS3YBL052C 2496 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YBR064WYBR064W 429 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 NOP14YDL148C 2433 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 HMI1YOL095C 2121 nt2.38□□□□□ -2.03
RTA1P53047 SSS1YDR086C 243 nt2.37□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YJL135WYJL135W 318 nt2.37□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.37□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.37□□□□□ -2.03
RTA1P53047 IRE1YHR079C 3348 nt2.37□□□□□ -2.03
RTA1P53047 VIK1YPL253C 1944 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 NUP170YBL079W 4509 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 snR72snR72 98 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 SIR4YDR227W 4077 nt2.36□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.35□□□□□ -2.03
RTA1P53047 snR80snR80 171 nt2.35□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YOL160WYOL160W 342 nt2.35□□□□□ -2.03
RTA1P53047 TDA9YML081W 3756 nt2.35□□□□□ -2.03
RTA1P53047 HER1YOR227W 3741 nt2.34□□□□□ -2.03
RTA1P53047 SCP160YJL080C 3669 nt2.34□□□□□ -2.03
RTA1P53047 NAB6YML117W 3405 nt2.34□□□□□ -2.03
RTA1P53047 IRA2YOL081W 9240 nt2.34□□□□□ -2.03
RTA1P53047 BUD2YKL092C 3315 nt2.34□□□□□ -2.03
RTA1P53047 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
RTA1P53047 SRP14YDL092W 441 nt2.33□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.33□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YBL012CYBL012C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.33□□□□□ -2.04
RTA1P53047 CAT2YML042W 2013 nt2.32□□□□□ -2.04
RTA1P53047 MLH3YPL164C 2148 nt2.32□□□□□ -2.04
RTA1P53047 NIP100YPL174C 2607 nt2.32□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YFR016CYFR016C 3702 nt2.32□□□□□ -2.04
RTA1P53047 MDM20YOL076W 2391 nt2.31□□□□□ -2.04
RTA1P53047 SAP190YKR028W 3102 nt2.31□□□□□ -2.04
RTA1P53047 SAP185YJL098W 3177 nt2.31□□□□□ -2.04
RTA1P53047 ZIP2YGL249W 2115 nt2.31□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.31□□□□□ -2.04
RTA1P53047 MSH5YDL154W 2706 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YGL041CYGL041C 204 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YGL052WYGL052W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 SEY1YOR165W 2331 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 FRK1YPL141C 2598 nt2.3□□□□□ -2.04
RTA1P53047 APL5YPL195W 2799 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 AGC1YPR021C 2709 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 PDE2YOR360C 1581 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 YPP1YGR198W 2454 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 TFC3YAL001C 3483 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 MSC6YOR354C 2079 nt2.29□□□□□ -2.04
RTA1P53047 DGR2YKL121W 2559 nt2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.4 ms