Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms