Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms