Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFSP49914 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFSP49914 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms