Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPFP49454 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPFP49454 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms