Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM4P49221 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms