Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TM4SF4P48230 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF4P48230 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms