Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCC3P46736 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCC3P46736 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms