Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOP2P46087 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOP2P46087 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOP2P46087 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOP2P46087 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOP2P46087 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOP2P46087 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms