Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms