Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC1A1P43005 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC1A1P43005 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms