Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDH1P40925 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDH1P40925 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDH1P40925 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH1P40925 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms