Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms