Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPB2P35606 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms