Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMI1P35226 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMI1P35226 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BMI1P35226 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BMI1P35226 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms